வல்லக்கோட்டை முருகன் கோவில், பாரம்பரியமாக கோடை நகர் என அழைக்கப்படும் இந்த திருத்தலம், தெய்வீக வெற்றியும் அரசரின் மீட்பும் ஒன்றிணைந்த சுமார் 1,200 ஆண்டுகள் பழமையான வரலாற்றைக் கொண்டதாகும். ஸ்தல புராணத்தின் படி, தேவர்களை அச்சுறுத்தி வந்த வல்லன் என்ற அசுரனை, அவனின் அபராஜிதக் கோட்டையில் (கோட்டை) இருந்து வந்து, முருகப்பெருமான் வதம் செய்த இடமே இந்தத் தலம். இறுதியில் அசுரன் கேட்ட வேண்டுகோளின் பேரில், அவனின் நினைவாக இத்தலம் “வல்லன் கோட்டை” எனப் பெயரிடப்பட்டதாக கூறப்படுகிறது. இன்றைய கோவில் அமைப்பு இலஞ்சி நாட்டின் மன்னர் பகீரதன் காலத்தைச் சார்ந்ததாக நம்பப்படுகிறது. நாரத முனிவரிடம் அகந்தையுடன் நடந்துகொண்டதால் தன் அரசை இழந்த மன்னர் பகீரதன், துர்வாச முனிவரின் ஆலோசனையின்படி இத்தலத்தில் உள்ள பதிரி மரத்தின் அடியில் கடும் தவம் மேற்கொண்டார். அவரது தவத்தால் மகிழ்ந்த முருகப்பெருமான், மன்னரின் செல்வமும் அரசையும் மீண்டும் வழங்கினார். அதற்கான நன்றிக்கடனாக மன்னர் இக்கோவிலைக் கட்டினார். இதனால், “இழந்ததை மீட்டளிப்பவர்” என்ற பொருளில், முருகப்பெருமான் கோடைய ஆண்டவர் எனப் புகழ்பெற்றார். இந்த ஆன்மீக பாரம்பரியத்தை 15-ஆம் நூற்றாண்டில் அருணகிரிநாதர் மேலும் மகிமைப்படுத்தினார். தெய்வீக கனவு ஒன்றின் பேரில் இத்தலத்திற்கு வந்த அவர், “கோடை நகர்” திருத்தலத்தின் இறைவனாக முருகப்பெருமானை போற்றி, திருப்புகழ் நூலில் எட்டு பாடல்களை இயற்றினார். இந்தக் கோவில், இந்தியாவிலேயே உயரமானதாக கருதப்படும் முருகன் சிலையை கொண்டிருப்பதற்காக உலகளவில் புகழ்பெற்றது. சுமார் 7 முதல் 9 அடி உயரம் கொண்ட இந்த நின்ற திருக்கோலச் சிலை, வள்ளி மற்றும் தெய்வயானை சமேதராக, கிழக்கு நோக்கி கருவறையில் அருள்பாலிக்கிறது. அமைதியான புன்னகையுடன் வடிவமைக்கப்பட்டுள்ள இந்தச் சிலையின் உயரம் காரணமாக, தினசரி அபிஷேகங்கள் மற்றும் அலங்காரங்களை செய்ய, அர்ச்சகர்கள் சிறப்பு மேடை ஒன்றைப் பயன்படுத்துகின்றனர். வியாழக்கிழமைகளில், வைரத்தால் அலங்கரிக்கப்பட்ட வேல் அணிவிக்கப்பட்ட முருகப்பெருமானின் தரிசனம், கல்வி வெற்றி, இழந்த செல்வம் மற்றும் நிலை மீட்பு ஆகியவற்றை நாடி ஆயிரக்கணக்கான பக்தர்களை ஈர்க்கிறது. திராவிடக் கலைப்பாணியில் கட்டப்பட்ட இக்கோவிலில், ஐந்து நிலை ராஜகோபுரமும், மேலும் தேவராஜன் இந்திரன் தன் வஜ்ராயுதம் கொண்டு உருவாக்கி, முருகப்பெருமானை வழிபட்டதாக நம்பப்படும் வஜ்ர தீர்த்தம் என்ற புனிதக் குளமும் அமைந்துள்ளன.